Isolasi, Identifikasi dan Karakteristik Antimicrobial Resistance Staphylococcus cohnii dari Perairan Semarang

Siti Nur Kholishah, Diah Permata Wijayanti, Mada Triandala Sibero

Abstract


Resistensi bakteri terhadap antibiotik merupakan salah satu masalah utama di bidang kesehatan saat ini, salah satunya adalah bakteri Staphylococcus cohnii. Bakteri tersebut dapat hidup di berbagai habitat termasuk lingkungan perairan. Cemaran antibiotik di lingkungan perairan adalah salah satu faktor yang meningkatkan resistensi bakteri. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui profil resistensi bakteri Staphylococcus cohnii dari perairan Semarang. Isolat didapat dari koleksi Laboratorium Natural Product Universitas Diponegoro. Isolat kemudian dikarakterisasi secara morfologi dan diidentifikasi secara molekuler. Selanjutnya resistensi isolat terhadap antibiotik diuji dengan metode Antimicrobial Susceptibility Test (AST). Diameter zona bening kemudian diukur setelah 24 jam dan disesuaikan dengan standar CLSI 2021. Karakteristik morfologi koloni ATL.215 yaitu berbentuk cicular atau bulat dengan elevasi convex atau cembung di bagian tengah dan margin entire atau tepian yang halus. Warna isolat pada kedua media adalah putih. Isolat diidentifikasi sebagai Staphylococcus cohnii berdasarkan identifikasi molekuler sekuens 16s rRNA dengan percent identity 99,93% dan query cover 100%. Berdasarkan hasil AST, isolat menunjukkan resistensi terhadap satu dari delapan antibiotik yaitu chloramphenicol dengan diameter zona bening 8,55 mm. Sedangkan pada tujuh antibiotik lain diameter zona bening yang didapatkan termasuk dalam kriteria susceptible.

Keywords


antibiotik; resistensi; Staphylococcus cohnii

Full Text:

PDF

References


Ayuningrum, D., R. Kristiana, M.A. Asagabaldan, A. Sabdono, O.K. Radjasa, H. Nuryadi dan A. Trianto. 2017. Isolation, Characterisation and Antagonistic Activity of Bacteria Symbionts Hardcoral Pavona sp. Isolated from Panjang Island, Jepara Against Infectious Multi-drug Resistant (MDR) Bacteria. IOP Conference Series: Earth and Environmental Science, 55(1).

Ayuningrum, D., Y. Liu, Riyanti, M.T. Sibero, R. Kristiana, M.A. Asagabaldan, Z.G. Wuisan, A. Trianto, O.K. Radjasa, A. Sabdono dan T.F. Schäberle. 2019. Tunicate-associated bacteria show a great potential for the discovery of antimicrobial compounds. PLoS ONE, 14(3): 1–14.

Basso, A.P., P.D. Martins, G. Nachtigall, S. van der Sand, T.M. de Moura dan A.P.G. Frazzon. 2014. Antibiotic resistance and enterotoxin genes in staphylococcus sp. Isolates from polluted water in southern Brazil. Anais da Academia Brasileira de Ciencias, 86(4): 1813–1820.

Bora, P., P. Datta, V. Gupta, L. Singhal dan J. Chander. 2018. Characterization and antimicrobial susceptibility of coagulase-negative staphylococci isolated from clinical samples. Journal of Laboratory Physicians, 10(04): 414–419.

CLSI. 2021. M100 Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing. 31 ed. Clinical and Laboratory Standards Institute.

Hanna, N., M. Purohit, V. Diwan, S.P. Chandran, E. Riggi, V. Parashar, A.J. Tamhankar dan C.S. Lundborg. 2020. Monitoring of water quality, antibiotic residues, and antibiotic-resistant escherichia coli in the kshipra river in india over a 3-year period. International Journal of Environmental Research and Public Health, 17(21): 1–22.

Harahap, M.K.A., S. Rudiyanti dan N. Widyorini. 2020. Analisis Kualitas Perairan Berdasarkan Konsentrasi Logam Berat dan Indeks Pencemaran di Sungai. Pasir Laut, 4(2): 108–115. DOI :

Kurnianti, L.Y. 2020. Analisis Beban Dan Status Pencemaran Bod Dan Cod Di Kali Asin, Semarang. JFMR-Journal of Fisheries and Marine Research, 4(3): 379–388.

Margarida, A., M. Olívia dan A. Lourenço. 2015. MorphoCol : An ontology-based knowledgebase for the characterisation of clinically significant bacterial colony morphologies. JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS, 55: 55–63.

Mendoza-Olazarán, S., J.F. Garcia-Mazcorro, R. Morfín-Otero, L. Villarreal-Treviño, A. Camacho-Ortiz, E. Rodríguez-Noriega, P. Bocanegra-Ibarias, H.J. Maldonado-Garza, S.E. Dowd dan E. Garza-González. 2017. Draft genome sequences of two opportunistic pathogenic strains of Staphylococcus cohnii isolated from human patients. Standards in Genomic Sciences, 12(1): 49. DOI :10.1186/s40793-017-0263-1.

Pratiwi, A.D., N.. Widyorini dan A. Rahman. 2019. Analisis Kualitas Perairan Berdasarkan Total Bakteri Coliform Di Sungai Plumbon, Semarang. Journal of Maquares, 8(3): 211–220.

Roberts, M.C. dan S. Schwarz. 2017. Tetracycline and Chloramphenicol Resistance Mechanisms. Antimicrobial Drug Resistance, 231–243.

Sibero, M.T., O.K. Radjasa, A. Sabdono, A. Trianto, D.W. Triningsih dan I.D. Hutagaol. 2018. Antibacterial activity of indonesian sponge associated fungi against clinical pathogenic multidrug resistant bacteria. Journal of Applied Pharmaceutical Science, 8(2): 088–094.

Srinivasan, R., U. Karaoz, M. Volegova, J. MacKichan, M. Kato-Maeda, S. Miller, R. Nadarajan, E.L. Brodie dan S. V. Lynch. 2015. Use of 16S rRNA gene for identification of a broad range of clinically relevant bacterial pathogens. PLoS ONE, 10(2): 1–22.

Wang, X., M. Zhang, J. Gao, T. Pu, M. Bilal, Y. Wang dan X. Zhang. 2018. Antifungal activity screening of soil actinobacteria isolated from Inner Mongolia, China. Biological Control, 127(June): 78–84.

Xu, Z., H. V. Mkrtchyan dan R.R. Cutler. 2015. Antibiotic resistance and mecA characterization of coagulase-negative staphylococci isolated from three hotels in London, UK. Frontiers in Microbiology, 6(SEP): 1–6.

Zhang, W., Y. Chen, Q. Shi, B. Hou dan Q. Yang. 2020. Identification of bacteria associated with periapical abscesses of primary teeth by sequence analysis of 16S rDNA clone libraries. Microbial Pathogenesis, 141: 103954.




DOI: https://doi.org/10.30743/best.v5i1.5295

Refbacks

  • There are currently no refbacks.


Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

 

 

https://scholar.google.co.id/citations?user=kvKzX3QAAAAJ&hl=id&authuser=4

Best Journal (Biology Education, Sains and Technology)

Program Studi Pendidikan Biologi, FKIP - Universitas Islam Sumatera Utara
Kampus Induk UISU Jl. Sisingamangaraja XII Teladan, Medan

Creative Commons License